A finales de la Segunda Guerra Mundial, aprovechando que el representativo estatal de Nuevo León había ganado un torneo aficionado de Primera Fuerza, algunos empresarios regiomontanos encabezados por Don Carlos Vertti, Enrique Ayala Medina, Paul C. Probert, Rogelio Cantú Gómez y Miguel Margáín Zozaya decidieron crear el Club de Futbol Monterrey, S. A. de C.V., el cual jugaría sus primeras temporadas en el Parque de Béisbol Cuauhtémoc.
Los inicios del Club de Futbol Monterrey se remontan a 1945, un año difícil por ser época de guerra y crisis.
En ese entonces el deporte que contaba con la atención de los regiomontanos, era el béisbol. Un equipo de futbol no era lo más viable por las preferencias de la sociedad pero eso no fue motivo suficiente para amedrentar a algunas personas que tenían firme la idea de lo que querían hacer.
El equipo fundado recibió el nombre de Club de Futbol Monterrey, S. A. de C.V. y las personas que estuvieron en esa primera directiva fueron las siguientes:
Presidente: Enrique Ayala Medina.
Vicepresidente: Paul C. Probert.
Secretario: Angel E. Escobedo.
Tesorero: CP Ramón Cárdenas Coronado.
Vocales: José Fidalgo Carrera, Ing. Alberto Guevara, Dr. Daniel Mir y contador Miguel Talavera Acevedo.
Comisarios: Rogelio Cantú Gómez y Miguel Margáín Zozaya.
Delegados en México: Emesto Ríos y Femando Carrera.
Manuel Galán fue el primer Director Técnico y el plantel lo formaron los siguientes jugadores:
Raymundo "Burro" Palomino, Victoriano de la Mora, Atenor "Negro" Medina, Octavio "Gene" Rivera, Enrique Lizano, José Luis "Cocoliso" Rodríguez Peralta, José Norberto Toledo, Miguel Quezada, Santiago Bonilla, y Gilberto "Muerto" Maciel.
Además de Atanasio "Chango" Medellín, Leonardo "Chanclas" Zamudio, Luciano Agnolín, Guillermo "Cuadros" Vidal, Evaristo Amézcua, Noé Gómez Tovar, Juan Bladé, Gonzalo Buanabad, Arnulfo Avilán, Ignacio Trelles y Cirilo García Razo.
También José "Che" Gómez, Emilio Baldonedo, Francisco Zeledón, A. Escalada, Juan Moya, A. Daccarett, Jesús y Luis Ontiveros, Víctor Lizardi, Rivas, Quiroga, Nava, Ramírez, Usial, Robles, Juan y Homero "La Cuchara" Carranza, Cristóbal "Catán" Liñán, Cruz Banda, Tello, "Negro" Arizmendi.
En los inicios del equipo, el primer uniforme utilizado por Monterrey era en color blanco, estaba cortado diagonalmente del hombro izquierdo a la cintura, con la franja en color azul.
Su primer juego en liga profesional se efectuó el 19 de Agosto de 1945 venciendo al San Sebastián de León por marcador de un gol a cero, con anotación de José "Che" Gómez. El equipo estaba compuesto por Raymundo "Burro" Palomino, Victoriano de la Mora, Atenor "Negro" Medina, Octavio "Gene" Rivera, Enrique Lizano, José Luis "Cocoliso" Rodríguez Peralta, José Norberto Toledo, Miguel Quezada, Santiago Bonilla, Gilberto "Muerto" Maciel, Atanasio "Chango" Medellín, Leonardo "Chanclas" Zamudio, Luciano Agnolín, Guillermo "Cuadros" Vidal, Evaristo Amézcua, Noé Gómez Tovar, Juan Bladé, Gonzalo Buanabad, Arnulfo Avilán, Ignacio Trelles, Cirilo García Razo, José "Che" Gómez, Emilio Baldonedo, Francisco Zeledón, A. Escalada, Juan Moya, Jesús y Luis Ontiveros, Víctor Lizardi, Juan y Homero "La Cuchara" Carranza, Cristóbal "Catán" Liñán y Cruz Banda; siendo dirigidos por Manuel Galán.
Los acontecimientos forzaron la retirada del club, que no pudo afrontar ninguna de las competiciones en las que participaba, a pesar de haber recibido el apoyo de los demás equipos de la Liga que les auxiliaron con el prestamo de jugadores, hecho que no fue suficiente para soportar embates como el del 26 de mayo de 1946, cuando los Rayados recibieron 14 goles en contra sin lograr anotar siquiera el de la honrrilla, lo cual marca la mayor goliza en la historia de nuestro futbol.
Entre otros resultados negativos en el ámbito deportivo sobresale el haber permitido 133 goles en la campaña, lo cual promediaba 4.4 goles por partido, lo que es un récord.
El equipo reapareció en 1952, gracias a la labor del Dr. Carlos Canseco, Presidente de la Asociación de futbol de Nuevo León. El Monterrey reingresó en la Segunda División en ese mismo año y cuatro después volvía a la Primera División. La vuelta fue efímera pues el equipo realizó una campaña lamentable y en la última jornada perdía la categoría y regresaría al circuito de ascenso.
Para la temporada 59-60 el Monterrey volvería a Primera División y a pesar de bailar muy cerca del abismo se mantuvo al final gracias a una mínima ventaja sobre Celaya y Zacatepec. Las cuatro siguientes temporadas fueron para Monterrey momentos de repunte ya que logró dos terceros lugares, un cuarto y un quinto.
Cerró la década de los 60 en posiciones de media tabla hacia abajo, en los primeros años de los 70 obtuvo dos terceros lugares, siendo la mejor, la temporada 73-74, en la cual ganó 22 de 34 partidos con lo que promedió 70.6 por ciento de puntos logrados. En 26 años de Liguillas, Monterrey calificó 12 veces y ganó una, la especial denominada México-86, el primer y único campeonato de los rayados en un torneo de Liga bajo la tutela de Franisco Avilán.
El 1 de Marzo de 1986 los Rayados conseguirían su primer título en primer división en el torneo México 86 (Solo se jugaron en 2 grupos y sin decenso) al vencer 2-0 en el partido de vuelta al Tampico Madero Futbol Club en el Estadio Tecnológico para finalizar 3-2 en el marcador global. Los goles fueron anotados por el brasileño Reinaldo Güeldini y por el mexicano Francisco Javier "El Abuelo" Cruz, quién terminaría como campeón de goleo esa temporada.
El 8 de Septiembre de 1991 los Rayados ganarían la extinta Copa México al ganar en casa por marcador de 4:2 a las Cobras de Ciudad Juárez. La alineación estaba compuesta por el portero Tirzo Carpizo; los defensas Antonio "La Moca" González, Rafael Bautista, Alejandro Hisis y Guillermo Muñoz; en la media Guillermo Vázquez, Alberto "Guamerú" García y Germán Ricardo Martellotto y en la delantera Misael Espinosa, Luis Antonio "Cadáver" Valdéz y Francisco Javier "El Abuelo" Cruz; los cuales eran dirigidos por Fernando Reynoso y Miguel Mejía Barón. Apenas un año antes, el mismo equipo (pero dirigido por el chileno Pedro García) había conseguido su mejor temporada en la historia al finalizar con 47 puntos en el torneo de Liga.
El campeonato de Copa le dio el derecho a disputar la Recopa de la CONCACAF, la cual ganó por marcador de 4-3 al equipo Luis Ángel Firpo de El Salvador con goles de Gerardo "El Chagui" Jiménez, Luis Hernández y dos del argentino Sergio "El Pibe" Verdirame.
El último título de su palmarés es el Campeonato del torneo Clausura 2003, de la mano del argentino Daniel Passarella como entrenador. El título lo ganó el 14 de Junio de 2003 como visitante ante el Club Monarcas Morelia de Michoacán por marcador global de 3 - 1. Los goles del Monterrey fueron anotados por el argentino Walter Erviti, Guillermo Franco (naturalizado mexicano) y el mexicano Héctor Castro de penal, descontando por el cuadro Michoacano Adolfo Bautista hacia el final del encuentro.
Después llegaron a otras dos Finales, la ultima la perdieron con el Club Deportivo Toluca por marcador global de 6-3, con un arbitraje polémico de Marco Antonio Rodríguez.
Tras varios torneos con bajo nivel fue cesado Miguel Herrera como entrenador regiomontano, en su relevo entró Issac Mizrahi, y después del Interliga llegó Ricardo La Volpe, con quien clasificaron a la Liguilla del Clausura 2008 derrotando al líder general, al Club Deportivo Guadalajara, en los Cuartos de Final por marcador global de 8-5. Posteriormente se enfrentaron en la Semifinal ante el Santos Laguna donde igualaron por global de 3-3, siendo eliminados debido a la mejor posición en la tabla general el conjunto rayado.
Un año después, en el Apertura 2005, los Rayados del Monterrey logran su mejor cosecha de puntos hasta entonces en la historia de los torneos cortos con 35 puntos y logrando imponer un récord en la historia de los torneos cortos como el equipo con más juegos consecutivos ganando como visitante (7); 6 de Liga y 1 de Liguilla, logrando así quedar en segundo lugar de la competencia y, tras vencer fácilmente a los Tecos de la UAG por global de 7-0, de nueva cuenta enfrentan al conjunto de los Tigres perdiendo el primer partido en la cancha del universitario 1-0 con gol de Sixto Peralta pero en el partido de vuelta ganaron 2-1 con el gol recordado de Guillermo Franco que a 5 minutos del final logra dar un remate de forma un poco ortodoxa para dar el pase a la final al club de Futbol Monterrey empatando en el global 2 - 2, lo cual le valió para acceder por mejor ubicación en la tabla general a la Gran Final contra el Club Deportivo Toluca, donde perdieron por marcador global de 6 - 3 con un polémico arbitraje en el juego de vuelta de Marco Antonio Rodríguez.
En el torneo Apertura 2006 llegaron a la liguilla, en el primer juego empataron 0:0 en el Estadio Tecnológico contra los Diablos Rojos del Toluca, pero en el de vuelta perdieron 2:1, con un gol de penal marcado por Sebastián "El Loco" Abreu, pero antes les habían anulado un gol de tiro libre ejecutado por Jesús "El Cabrito" Arellano. Con un marcador global final de 2:1 el equipo de Miguel "El Piojo" Herrera, fue eliminado de la liguilla.
Tras varios torneos con bajo nivel fue cesado Miguel Herrera como entrenador regiomontano, en su relevo entró Isaac Mizrahi, y después del Interliga llegó Ricardo La Volpe, con quien clasificaron a la liguilla del Clausura 2008 derrotando al líder general, al Club Deportivo Guadalajara, en los Cuartos de Final por marcador global de 8-5. Posteriormente se enfrentaron en la Semifinal ante el Santos Laguna donde igualaron por global de 3-3, siendo eliminados debido a la mejor posición en la tabla general el conjunto Lagunero.
Tras haber pasado a la liguilla y ya con Víctor Manuel Vucetich en el banquillo, Monterrey se encontraba en el quinto lugar de los 8 equipos ya clasificados. Su primer rival sería el equipo de las águilas del Club América, en donde en el global terminaría en un 2-1 siendo el Monterrey quien pasaría a la siguiente ronda, siendo que en el partido de ida rayados ganaría con un gol de Aldo de Nigris que sería el jugador más inspirado ya que su hermano Antonio de Nigris había fallecido en Grecia por un problema cardiaco.
El partido de vuelta rayados caía 1-0 frente al América pero 10 minutos antes de acabar el partido Humberto Suazo anotaría el 1-1 y el pase a las semifinales dejando a las águilas fuera del torneo. Estando en la semifinal, el Monterrey jugaría contra los diablos rojos del Club Deportivo Toluca, quienes habían ganado la final contra rayados en la Apertura 2005; Monterrey saldría a ganarles con dos goles de ida, y un empate de uno a uno de regreso, dejando el global con 3-1.
El partido de ida de la final, se llevó acabó en el Estadio Tecnológico de Monterrey, ganando los rayados 4-3 contra el Cruz Azul después de una recuperada histórica del club Monterrey que al minuto 4 ya ganaba 1-0 para que después en un lapso de 20 minutos los azules cambiaran el rumbo y se impusieran 3-1 tal parecía que la copa ya tenía dueño, pues los rayados no sólo perdían si no que también demostraban una debilidad en la zona defensiva y falta de concentración como no se les había visto en todo el torneo, al salir de los vestidores al segundo tiempo los rayados acostumbrados a luchar contra la adversidad y con una gran motivación por parte del estratega Víctor Manuel Vucetich los rayados cambiaron drásticamente el juego, salieron al terreno de juego con la convicción de ganar y así lo hicieron terminando el partido de ida 4-3 en un juego lleno de errores y contrastes por parte de los dos equipos, pero todo se dio por hecho 13 de Diciembre del 2009 en el Estadio Azul, dejando un marcador de 2-1 ganando los rayados del Monterrey, viendo su participación como la mejor posible, pues durante toda la liguilla no cayeron ante ningún equipo, siendo los justos vencedores.
Ya en el enero del 2010 y después de solamente realizar una pretemporada de 4 días; los Rayados de Monterrey se imponen al Club América en la Final del Torneo Interliga 2010 en la tanda de penales 3-1 al terminar empatados 0-0 en tiempo regular, cabe destacar la intervención del cancerbero de Monterrey Jonathan Orozco, que atajo dos tiros penales para así poder agenciar de nueva cuenta un título para su equipo. Pavel Pardo, jugador americanista, desperdició el cuarto disparo de su equipo, sentenciando así el cupo del torneo continental a manos de los Rayados, con esto el Monterrey consiguió su pase directo a la Copa Libertadores 2010 como México 2, donde enfrento en el Grupo 2 al Once Caldas de Colombia, Nacional de Paraguay y al São Paulo de Brasil, realizando una actuación discreta ya que terminó tercero en el grupo con 6 puntos.
En el torneo local el Club de Fútbol Monterrey clasifica como superlíder a la liguilla del Torneo Bicentenario 2010 tras empatar en la última jornada 1-1 con el Club Monarcas Morelia en el Estadio Morelos y así conseguir 36 unidades lo que representa su mejor cosecha de puntos en torneos cortos.
En los cuartos de final los Rayados del Monterrey se enfrentaron al Club de Fútbol Pachuca perdiendo 1-0 en el partido de ida y en el partido de vuelta en el Estadio Tecnológico los Rayados perdieron por un marcador de 2-1 para finalmente terminar con marcador global de 3-1 en favor del Pachuca y así ser eliminados del Bicentenario 2010.
Tras un buen torneo, el Monterrey entra a la liguilla con un total de 32 puntos; como segundo lugar general de la tabla, en la cual tendría que enfrentarse al Pachuca con una desventaja técnica ya que en el último partido del torneo regular ante las Chivas de Guadalajara, sufrió tres expulsiones de elementos importantes como Jonathan Orozco, Luis Ernesto Pérez y Severo Meza.
Aún así, con un empate global de 4-4 ante el Pachuca los Rayados de Monterrey avanzaron a semifinales por mejor posición, tocando el turno de medirse ante los Pumas de la UNAM. Con un ajustado marcador global de 2-0, el equipo Monterrey accedió a la final de nueva cuenta como lo había logrado un año atrás.
Tocaría entonces el turno de enfrentar al equipo de Santos Laguna quien había clasificado a la liguilla como tercero de la tabla general. El resultado al término de los 90 minutos del primer partido de la final fue a favor de los locales (Santos Laguna) por marcador de 3 goles contra 2 gracias a un error en la defensiva de los visitantes con un autogol del defensa veterano Duilio Davino.
El 5 de diciembre de 2010 en el encuentro final de regreso jugado en el Estadio Tecnológico, el partido culminó en su primera mitad con la ventaja para los locales de 1-0. En los últimos 45 minutos el equipo del Monterrey logró 2 goles que dejarían el marcador 3-0 (global 5-3, donde Humberto Suazo fue el autor de 3 goles), con lo cual el equipo regiomontano de la mano de Víctor Manuel Vucetich conseguiría su 4º título del fútbol mexicano.
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